I skärgården finns ett flertal vandrarhem utspridda mellan Örskär i norr och Landsort i söder. Alla vandrarhem på Skärgårdsstiftelsens mark, utom Tullhuset på Huvudskär, drivs av entreprenörer som arrenderar anläggningarna. Därför går det inte att boka boende genom genom oss. Det gör du istället direkt med vandrarhemmen. Flera av vandrarhemmen är STF-anslutna och kan bokas via deras hemsida.
Norra skärgården
Örskär
Arholma
Lidö
Riddersholm
Finnhamn
Mellanskärgården
Träskö-Storö (Stora Kalhomen)
Grinda
Gällnö
Rögrund
Södra skärgården
Gålö
Fjärdlång
Huvudskär
Utö
Nåttarö